課程規劃主要針對「組織工程」、「生物醫學儀器」、「生物感測器」、「生物醫學影像」等四大研究研究領域，目標乃是培育生醫工程之全方位人才。除生醫工程所開授之課程外，學生可依其背景與未來發展方向，選修工學院、生命科學院、農資學院、獸醫學院相關課程。

※最低畢業學分為34學分，其中必修學分為28學分（生醫工程導論6學分、專題討論(三)2學分、專題討論(四)2學分、基礎解剖及生理學(上)3學分、基礎解剖及生理學(下)3學分、博士論文12學分），選修學分為6學分。

 畢業條件明細表

 博士學位候選人資格考核申請流程：

※「博士學位候選人資格考核施行細則及博士學位考試注意事項」、「資格考核審核委員名單」、「研究計畫書」，至資料下載頁面下載；「博士候選人資格考核申請書」、「論文口試評分單」、「通過博士候選人資格考核通知書」至註冊組網頁下載。

※每學期實際開設課程可登入興大入口後進入教務系統查詢，亦可透過課程查詢系統確認。
※選修課程請參考碩士班課程規劃。